260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5317 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 217 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  63 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  60.82 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  59.79 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  54.45 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  51.17 
 
 		 300 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  57.8 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  52.88 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  50.95 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  52.26 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  50 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  52.8 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 		 260 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  48.63 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 259 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 259 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  44.68 
 
 		 273 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  43.33 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  43.39 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  39.02 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  38.89 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  39.87 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  48.89 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  39.87 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 189 aa  98.2  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 189 aa  94.7  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  42.01 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  51.38 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.78 
 
 		 197 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 178 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  40.67 
 
 		 227 aa  91.7  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.07 
 
 		 197 aa  91.7  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  35.15 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.54 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.93 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 196 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.93 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.93 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  43.03 
 
 		 427 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  41.72 
 
 		 285 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  41.42 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.52 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  36.67 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  45.93 
 
 		 333 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  33.87 
 
 		 191 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  35.33 
 
 		 190 aa  88.2  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>