262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0257 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 246 aa  474  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  64.29 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  54.41 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  59.17 
 
 		 203 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  55.61 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  52.53 
 
 		 213 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  53.92 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  53.05 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  54.91 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  52.61 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  54.6 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  57.8 
 
 		 217 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  53.23 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  50.27 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  50.27 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  50.27 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  43.04 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 223 aa  148  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  49.73 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  51.08 
 
 		 269 aa  141  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  54.84 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  49.71 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  47.47 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  41.04 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  43.05 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  43.05 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 195 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  34.55 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  39.49 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 198 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  36.97 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.94 
 
 		 483 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.69 
 
 		 202 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  36.02 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.75 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 220 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.94 
 
 		 427 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.49 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.49 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 195 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 195 aa  89  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 195 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 200 aa  88.6  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.49 
 
 		 333 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.65 
 
 		 199 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.49 
 
 		 427 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  35.23 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.7 
 
 		 197 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 189 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.38 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.09 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  39.35 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>