260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0470 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  72.64 
 
 
215 aa  280  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  59.7 
 
 
221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  62.01 
 
 
203 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
230 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  60.8 
 
 
278 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 
239 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
300 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
231 aa  201  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  56.42 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  50.5 
 
 
213 aa  197  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  63.48 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
234 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
246 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  50 
 
 
213 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  53.66 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  50.72 
 
 
269 aa  158  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 
223 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
239 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  46.52 
 
 
225 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  48.06 
 
 
237 aa  141  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 
291 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  43.52 
 
 
212 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  46.57 
 
 
225 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  43.39 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  43.78 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 
259 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  50.25 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
259 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
259 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  38.59 
 
 
260 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
231 aa  104  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 
211 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
214 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  41.14 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  41.14 
 
 
168 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  35.19 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  40 
 
 
216 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
235 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  37.21 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 
194 aa  88.6  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40.72 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  35.29 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 
191 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
239 aa  85.1  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.2 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  37.58 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
195 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.1 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  32.3 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  38.51 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  34.97 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  39.05 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  39.05 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  39.05 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.51 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  39.05 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  39.05 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.74 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  34.95 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  38.89 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  37.93 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.05 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  39.35 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>