270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1949 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1949  NUDIX hydrolase  100 
 
 
224 aa  427  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
223 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 
231 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  52.7 
 
 
237 aa  188  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3375  NUDIX hydrolase  58.2 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18200  NUDIX family protein  55.73 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8861  NUDIX hydrolase  48.97 
 
 
239 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  45.85 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0470  hypothetical protein  51.06 
 
 
213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.779717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4317  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  47.72 
 
 
278 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
254 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  48.4 
 
 
229 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0721  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
234 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4757  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
231 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0108621  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1069  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0257  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
259 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
259 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  46.74 
 
 
291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
300 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13703  hypothetical protein  44.51 
 
 
273 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0211128 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5317  NUDIX hydrolase  48.73 
 
 
217 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  45 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1375  NUDIX hydrolase  43.32 
 
 
260 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1374  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3928  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 
234 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
260 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0206  NUDIX hydrolase  45.75 
 
 
215 aa  118  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0488394  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0342  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25380  ADP-ribose pyrophosphatase  39.71 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0421  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 
233 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218959  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  38.59 
 
 
214 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
219 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.46 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
231 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
245 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
211 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  42.28 
 
 
168 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  42.28 
 
 
168 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
207 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.87 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
207 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
191 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
199 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 
195 aa  94.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
210 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.1 
 
 
199 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
243 aa  92.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.8 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26210  NUDIX family protein  39.46 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0881576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
211 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  34.27 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
177 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
234 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
187 aa  88.2  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  35.14 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  35.53 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  34 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
230 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
197 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
216 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  32.91 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  34.92 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  40.94 
 
 
195 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  38 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  37.76 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3227  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.86 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  35.45 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 
239 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  36.81 
 
 
190 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
221 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.46 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4270  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.52337  normal  0.33973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  29.84 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>