255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1022 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 216 aa  151  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  44.67 
 
 		 211 aa  144  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  39.68 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 219 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  36.75 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 243 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  40.37 
 
 		 190 aa  91.7  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 198 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  40.28 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  35.33 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 244 aa  86.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  38.12 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  37.58 
 
 		 267 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  35.26 
 
 		 221 aa  84.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  32.3 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  32.74 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  34.68 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  33.94 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  36.11 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  33.53 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  34.5 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  36.2 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  36.84 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.16 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1918  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.63498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.16 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.16 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  31.9 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.8 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.33 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  35.14 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0164  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410349  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.9 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.8 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  34.36 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  34.36 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  37.21 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  34.36 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  34.36 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  34.36 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  32.72 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>