14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1964 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1964  MutT/nudix family protein  100 
 
 
163 aa  333  7.999999999999999e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0533  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
202 aa  90.1  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0466336  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1287  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  31.21 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2083  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
221 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1891  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
179 aa  57.8  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.08 
 
 
216 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1568  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
246 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.82 
 
 
216 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
211 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  24.31 
 
 
195 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>