244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2125 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2125  NUDIX hydrolase  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1840  MutT/nudix family protein  97.95 
 
 
245 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0464  NUDIX hydrolase  67.01 
 
 
327 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
207 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
198 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
178 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  41.14 
 
 
203 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  33.89 
 
 
198 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  35.29 
 
 
203 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  34.91 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.58 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  35.44 
 
 
192 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  38.04 
 
 
197 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  29.71 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  37.42 
 
 
197 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
199 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
199 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
210 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.79 
 
 
204 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  41.51 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
198 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  27.98 
 
 
267 aa  85.9  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  34.97 
 
 
192 aa  86.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.98 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.87 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.61 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  43.96 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.87 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.98 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.23 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.87 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.98 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  39.62 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  38.89 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  29.55 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
223 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
237 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
198 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  34.62 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1406  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  34.62 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  34.62 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  32.93 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  30 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
189 aa  79  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  33.96 
 
 
285 aa  79  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  29.41 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
191 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  27.37 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
210 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  31.25 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>