More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1874 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  64.44 
 
 		 181 aa  251  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  63.13 
 
 		 196 aa  240  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  60.22 
 
 		 182 aa  231  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  63.79 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 		 181 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  62.57 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  63.13 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  62.57 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  60.11 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  60.11 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  64.29 
 
 		 183 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  60.92 
 
 		 181 aa  223  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 181 aa  221  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 		 181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  60.57 
 
 		 198 aa  220  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  60.92 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  60.89 
 
 		 194 aa  218  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  57.47 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 		 187 aa  216  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  59.78 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  58.24 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  59.88 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  56.73 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  56.57 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  59.17 
 
 		 183 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  58.58 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  58.58 
 
 		 183 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  59.26 
 
 		 183 aa  200  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  52.87 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  57.99 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  53.53 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  55.42 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  56.89 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  55.09 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  53.8 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  53.49 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  53.99 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 183 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  49.11 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  54.25 
 
 		 157 aa  177  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  54.86 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  46.33 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  47.13 
 
 		 187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  45.98 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  52.29 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 187 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  38.15 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  28.82 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.45 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  31.71 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  30.86 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  34.29 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>