More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2820 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  93.75 
 
 		 176 aa  340  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  82.18 
 
 		 178 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  79.89 
 
 		 178 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 178 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 178 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  78.86 
 
 		 178 aa  294  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.77 
 
 		 184 aa  287  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.31 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.31 
 
 		 209 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.31 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.31 
 
 		 209 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.31 
 
 		 209 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  79.31 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  79.31 
 
 		 183 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  64.71 
 
 		 193 aa  231  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  64.12 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  63.53 
 
 		 193 aa  227  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 194 aa  224  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  58.86 
 
 		 198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  57.4 
 
 		 177 aa  207  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  57.99 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  59.3 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 192 aa  194  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 		 189 aa  187  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 184 aa  87.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  33.73 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  39.86 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  29.94 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  39.42 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  29.76 
 
 		 283 aa  71.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 314 aa  71.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  36.49 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 382 aa  67.8  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  31.58 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  32.54 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  30.86 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  28.57 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 339 aa  64.7  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 323 aa  64.3  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  32.61 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  29.32 
 
 		 265 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  30.29 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 341 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  31.25 
 
 		 282 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  31.07 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  29.05 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  27.82 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  29.24 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 319 aa  61.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  31.29 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>