More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2385 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  99.47 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  81.08 
 
 		 189 aa  319  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  75.27 
 
 		 192 aa  290  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  67.23 
 
 		 177 aa  266  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  65.26 
 
 		 200 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  70.29 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  70 
 
 		 204 aa  258  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  64.71 
 
 		 180 aa  234  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.64 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.64 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.86 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.86 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  63.86 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  64.42 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.86 
 
 		 183 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  63.8 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  60.71 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  63.8 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  59.04 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  61.35 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 		 193 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  61.35 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  61.35 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.24 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  59.51 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  59.51 
 
 		 176 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  38.62 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  37.67 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  34.06 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  29.73 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  29.75 
 
 		 283 aa  71.2  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  33.88 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 341 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  33.88 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  25.15 
 
 		 289 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  30.5 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 288 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  35 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  33.91 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30208  predicted protein  29.87 
 
 		 401 aa  65.1  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 198 aa  64.3  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  27.4 
 
 		 271 aa  64.3  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  27.86 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  33.62 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  29.22 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  34.43 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  31.78 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  30.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 		 314 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  24.49 
 
 		 281 aa  62  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 289 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>