234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0257 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  100 
 
 
325 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  59.34 
 
 
321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  53.09 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  51.78 
 
 
315 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  52.48 
 
 
305 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  46.23 
 
 
310 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  47.21 
 
 
312 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
310 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  46.18 
 
 
310 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  45.87 
 
 
342 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
305 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
315 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  61.42 
 
 
319 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 
319 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  60.91 
 
 
319 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  45.13 
 
 
327 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  43.31 
 
 
319 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
319 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  45.34 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  40 
 
 
319 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  43.77 
 
 
293 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
323 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  45.34 
 
 
315 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
323 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  39.49 
 
 
321 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
327 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
289 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 
339 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
382 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 
317 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 
317 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  39.03 
 
 
318 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
317 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  41.08 
 
 
303 aa  186  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 
306 aa  185  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  41.04 
 
 
307 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  40.07 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 
305 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  39.4 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  48.4 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  36.54 
 
 
308 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  32.02 
 
 
474 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  48.35 
 
 
332 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  37.41 
 
 
303 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  38.49 
 
 
331 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  31.38 
 
 
415 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
314 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  49.68 
 
 
348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  37.33 
 
 
282 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
341 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
301 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.89 
 
 
329 aa  149  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  49.37 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  44.92 
 
 
343 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  38.68 
 
 
325 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
278 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
352 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  44.15 
 
 
301 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
315 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
261 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
286 aa  142  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  45.93 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
319 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
298 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
262 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
316 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  47.34 
 
 
392 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  36.86 
 
 
308 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  37.19 
 
 
308 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
315 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  41.71 
 
 
313 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  45.09 
 
 
326 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  37.06 
 
 
260 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  41.18 
 
 
311 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  41.18 
 
 
311 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  44.91 
 
 
283 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  41.18 
 
 
311 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  43.37 
 
 
291 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  36.62 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  40.84 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  30.36 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  38.55 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
358 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
280 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  40.69 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  40.45 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  45.65 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  44.94 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
288 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  38.43 
 
 
278 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>