More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3171 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 177 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  84.88 
 
 		 177 aa  320  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  70.29 
 
 		 187 aa  262  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  71.18 
 
 		 192 aa  262  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  70.93 
 
 		 204 aa  260  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  70.29 
 
 		 187 aa  260  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  65.71 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  64.2 
 
 		 180 aa  240  9e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  60.48 
 
 		 200 aa  225  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.89 
 
 		 209 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.89 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  57.89 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.89 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.89 
 
 		 209 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.89 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.89 
 
 		 209 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  57.99 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  58.48 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  58.48 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  59.64 
 
 		 193 aa  203  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  59.64 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  57.4 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 		 178 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  57.4 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.56 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  36.49 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  33.33 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  28.38 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  28.87 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  34.17 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  29.94 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  25.98 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  26.59 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  29.71 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  33.9 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  28.17 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  28.78 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  26.58 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  24.82 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  27.4 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 286 aa  60.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  26.71 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>