More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3823 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  75.96 
 
 		 182 aa  291  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  75.82 
 
 		 182 aa  291  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  75.82 
 
 		 182 aa  291  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  74.18 
 
 		 196 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  71.2 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  71.91 
 
 		 187 aa  271  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  69.83 
 
 		 181 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  68.57 
 
 		 183 aa  258  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  62.64 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  58.24 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  58.52 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  56.82 
 
 		 181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  54.4 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  53.3 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  55.68 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  55.68 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 181 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  52.75 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  54.44 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  51.19 
 
 		 173 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  53.89 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  50.58 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  47.67 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  47.09 
 
 		 181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  49.13 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  47.67 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  50.61 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  46.51 
 
 		 183 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  53.89 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 157 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  44.24 
 
 		 187 aa  144  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  37.06 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 187 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 187 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  43.87 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  26.14 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.08 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  34.01 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  25.3 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 171 aa  62  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  28.77 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  22.86 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.06 
 
 		 530 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>