More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1292 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  99.44 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  95.51 
 
 		 178 aa  353  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  94.38 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  94.38 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  93.82 
 
 		 178 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  91.57 
 
 		 178 aa  340  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  84.18 
 
 		 184 aa  307  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  83.62 
 
 		 183 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 183 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 183 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 183 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 209 aa  303  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 209 aa  303  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.62 
 
 		 209 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  81.61 
 
 		 176 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  81.61 
 
 		 176 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  64.57 
 
 		 193 aa  233  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  65.88 
 
 		 193 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  64.57 
 
 		 193 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  64.42 
 
 		 187 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  58.19 
 
 		 200 aa  210  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  63.8 
 
 		 187 aa  207  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  58.48 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  57.31 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  55.23 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  40.62 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  32.32 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  41.04 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  30.88 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  38.02 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  35.97 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  33.61 
 
 		 312 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 327 aa  67.8  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  32.8 
 
 		 326 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  29.92 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  30.99 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  37.84 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  31.33 
 
 		 303 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  31.62 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  31.97 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  32.54 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  29.06 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  33.61 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  32.38 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  33.06 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>