271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2188 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  100 
 
 
315 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  76.11 
 
 
319 aa  477  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  51.78 
 
 
325 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 
321 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  55.6 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  51.84 
 
 
300 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  48.23 
 
 
305 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  45.13 
 
 
312 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 
310 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  46 
 
 
310 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
342 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  47.56 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  49.28 
 
 
319 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  58.94 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
310 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  47.45 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  46.25 
 
 
327 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 
319 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  44.66 
 
 
319 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  43.71 
 
 
319 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 
293 aa  229  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  45.07 
 
 
315 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
326 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  45.07 
 
 
315 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  41.45 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 
289 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  40.39 
 
 
321 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  46.64 
 
 
327 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  41.93 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  55.85 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  54.44 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
327 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
306 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 
317 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  50 
 
 
317 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  39.76 
 
 
332 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  38.49 
 
 
339 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
303 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  40.65 
 
 
307 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
314 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  39.2 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  34.82 
 
 
474 aa  172  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  32.89 
 
 
415 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
307 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  36.24 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  52.23 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
301 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  38.54 
 
 
303 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  47.28 
 
 
321 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  37.03 
 
 
305 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  41.34 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
261 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  40 
 
 
286 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  44.75 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  38.11 
 
 
325 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.93 
 
 
343 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
314 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 
331 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  43.87 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
318 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  44.79 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  44.1 
 
 
278 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 
319 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.46 
 
 
329 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  38.37 
 
 
311 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  38.37 
 
 
311 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  38.37 
 
 
311 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  43.08 
 
 
278 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
262 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
278 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 
321 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
315 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  43.55 
 
 
430 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  37.01 
 
 
308 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  37.82 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  32.73 
 
 
289 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  37.23 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  45.3 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  42.61 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  34.88 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  44.67 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  35.2 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  43.18 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  34.6 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  32.61 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  40 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  37.61 
 
 
276 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  38.37 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>