234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0108 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  100 
 
 		 321 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  62.58 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  62.89 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  57.68 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  54.82 
 
 		 323 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  40.58 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  42.21 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  42.9 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  41.56 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  51.71 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  40.39 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  41.31 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  49.76 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  37.43 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  49.27 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  48.76 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  43.29 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  47.25 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  36.01 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  44.09 
 
 		 474 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  49.72 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  49.14 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  42.78 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.63 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  34.22 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  46.63 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  37.67 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  36.28 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  45.35 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  38.11 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 261 aa  143  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 341 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  45.29 
 
 		 262 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  40.21 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  39.7 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  39.46 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  34.89 
 
 		 294 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  39.18 
 
 		 430 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  42.17 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  38.74 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.48 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  35.25 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  35.25 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  32.28 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  35.25 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  35.6 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  38.59 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  39.13 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  37.08 
 
 		 175 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  34.15 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  35.58 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  38.89 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  39.79 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  40.36 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  33.47 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  36.76 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  43.67 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  35.52 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  36.22 
 
 		 257 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  36.22 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  35.59 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  36.22 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  36.76 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  35.68 
 
 		 257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>