259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4911 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  94.98 
 
 		 319 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  85.27 
 
 		 319 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  63.12 
 
 		 305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  61.89 
 
 		 305 aa  340  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  60.73 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  51.39 
 
 		 321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  51.45 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  48.32 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  49.28 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  60.91 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  49.45 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  47.23 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  51.41 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  54.66 
 
 		 323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  49.45 
 
 		 315 aa  239  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  44.52 
 
 		 319 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  57.29 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  56.81 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  57.29 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  53.66 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  52.71 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  44.67 
 
 		 303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  46.44 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 319 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  48.07 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  55.68 
 
 		 317 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  58.24 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  46.35 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  45.96 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  46.77 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  41.11 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  43.81 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  41.95 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.52 
 
 		 329 aa  158  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  45.36 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  42.99 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  42.64 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  39.21 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  45.11 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  42.21 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  36.27 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  47.31 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.24 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 262 aa  152  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  39.47 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  40.08 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 341 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  43.07 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  38.77 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  40.09 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  47.49 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  37.54 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  37.9 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  46.75 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  41.97 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  32.52 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  36.52 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  42.79 
 
 		 392 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  37.63 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  39.9 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  33.83 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  46.71 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  39.02 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  32.11 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  49.01 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  39.22 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  39.73 
 
 		 278 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  40.69 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  39.22 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>