262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3430 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 326 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  64.81 
 
 		 319 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  65.43 
 
 		 319 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  57.68 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  55.88 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  47.66 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  45.94 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  45.62 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  56.81 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  44.69 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  54.72 
 
 		 319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  54.72 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 325 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  44.77 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  44.52 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  44.01 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  40.06 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 303 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  53.76 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  53.76 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  38.69 
 
 		 312 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  40.06 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  49.46 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  43.48 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  38.49 
 
 		 307 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  38.71 
 
 		 415 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  33.44 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  42.42 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  34.5 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  40.1 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  47.34 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  42.25 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  42.2 
 
 		 289 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.62 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  45.76 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  44.57 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  37.56 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  44.74 
 
 		 278 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  39.68 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  37.56 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 280 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  42.46 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  37.22 
 
 		 175 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  42.17 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  38.36 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  34.55 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  42.11 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  45.51 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  34.68 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  36.98 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  34.3 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  34.71 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  34.71 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  34.71 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  34.51 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  37.29 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 271 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  43.48 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  40.52 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  30.42 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>