More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4377 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  100 
 
 
257 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  99.22 
 
 
257 aa  530  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  99.61 
 
 
257 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  99.22 
 
 
257 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  99.61 
 
 
257 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.117835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  93.39 
 
 
257 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  93.39 
 
 
257 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  93.39 
 
 
257 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  93.39 
 
 
257 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  93.39 
 
 
257 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  93.39 
 
 
257 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  93 
 
 
257 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  93 
 
 
257 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  92.22 
 
 
257 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  90.27 
 
 
258 aa  488  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  75.49 
 
 
260 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  75.88 
 
 
260 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  75.88 
 
 
260 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  75.29 
 
 
255 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  70.75 
 
 
257 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  70.04 
 
 
260 aa  377  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  69.26 
 
 
260 aa  371  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  67.59 
 
 
257 aa  357  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  46.86 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  46.94 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  45.78 
 
 
269 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  45.1 
 
 
265 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
271 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 
261 aa  188  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  43.23 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  44.5 
 
 
272 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  41.2 
 
 
278 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  49.2 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  38.59 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  44.94 
 
 
271 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 
291 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  44.32 
 
 
281 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  37.65 
 
 
289 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  49.17 
 
 
277 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  41.71 
 
 
276 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 
278 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  41.99 
 
 
260 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  40.71 
 
 
273 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  42.18 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  42.18 
 
 
276 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  45.24 
 
 
289 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
314 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  35.02 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  41.71 
 
 
276 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
262 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  41.23 
 
 
276 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  43.27 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  36.96 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  35.27 
 
 
314 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
298 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  41.71 
 
 
278 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  38.19 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 
351 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
297 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 
341 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  38.01 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
303 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  42.6 
 
 
175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 
317 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
317 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
319 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  40.98 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  40.22 
 
 
303 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  38.8 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  38.79 
 
 
279 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  37.13 
 
 
315 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
327 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 
329 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
319 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
310 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  36.63 
 
 
331 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  36.92 
 
 
332 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
323 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
321 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
319 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  36.51 
 
 
307 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  38.22 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
305 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  41.52 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  38.12 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>