More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1940 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  43.2 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 
271 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  49.73 
 
 
278 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  50 
 
 
278 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
294 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  45.26 
 
 
271 aa  175  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  40.27 
 
 
260 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  51.87 
 
 
277 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  42.44 
 
 
260 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  46.86 
 
 
303 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
280 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 
261 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  41.97 
 
 
273 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
291 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  54.12 
 
 
276 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  54.12 
 
 
276 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  46.47 
 
 
289 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
286 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  48.28 
 
 
272 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  53.53 
 
 
276 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  53.53 
 
 
276 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  48.68 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  47.42 
 
 
278 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  50.27 
 
 
278 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  40.49 
 
 
260 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  38.68 
 
 
257 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
281 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
298 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
278 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  40.49 
 
 
257 aa  159  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
261 aa  157  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
288 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  48.3 
 
 
277 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  36.4 
 
 
289 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  37.5 
 
 
282 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
319 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  38.4 
 
 
257 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  37.97 
 
 
257 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  38.63 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  52 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  38.63 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  37.97 
 
 
257 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  38.76 
 
 
257 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
327 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  38.76 
 
 
257 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  38.28 
 
 
257 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  45.08 
 
 
332 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
319 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
314 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
314 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  37.24 
 
 
260 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  37.24 
 
 
260 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  43.58 
 
 
307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  48 
 
 
317 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  36.75 
 
 
255 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  34.54 
 
 
258 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 
305 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  36.4 
 
 
260 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
317 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  45.29 
 
 
321 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  48.1 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  36.59 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  42.77 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
318 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  52.52 
 
 
293 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  44.07 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  37.5 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
319 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  40.35 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.23 
 
 
331 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
325 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
317 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 
315 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  43.78 
 
 
303 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
301 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  38.95 
 
 
269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
358 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
326 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
339 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  47.16 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.36 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  38 
 
 
351 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  42.51 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 
358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>