More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0246 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 271 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  51.28 
 
 		 277 aa  270  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  43.35 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  45.82 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  47.96 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  46.79 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  46.79 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  46.79 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  49.3 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  46.79 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  46.79 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  46.79 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  48.83 
 
 		 260 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  46.79 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  46.79 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  46.33 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  45.87 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  46.33 
 
 		 257 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  46.33 
 
 		 257 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  46.33 
 
 		 257 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  41.86 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  45.87 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  47.03 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  44.49 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  44.49 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  52.66 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  44.09 
 
 		 260 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 281 aa  195  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  40.93 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  48.4 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  38.55 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  45.33 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  44.39 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  41.85 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  43.12 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  45.33 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  51.46 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  38.02 
 
 		 276 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  37.98 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  38.7 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  44.02 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  44.02 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  44.02 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  43.54 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  43.54 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  44.98 
 
 		 278 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  38.17 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  38.94 
 
 		 282 aa  155  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  45.99 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  36.33 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 261 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  34.14 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  36.05 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  34.72 
 
 		 289 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 298 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 358 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.24 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  33.21 
 
 		 339 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  34.04 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  32.96 
 
 		 319 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  35.15 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 331 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  39.8 
 
 		 303 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  44.06 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  42.68 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  34.7 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  39.08 
 
 		 175 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  39.58 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  37.78 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 306 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>