218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0831 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 358 aa  731    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  78.31 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 280 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  40.38 
 
 		 289 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  42.63 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.33 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  44.5 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  41.62 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  41.41 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  40.4 
 
 		 260 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  40.78 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  41.41 
 
 		 257 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 261 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  41.08 
 
 		 261 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  39.07 
 
 		 276 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  38.97 
 
 		 265 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  40.91 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  40.91 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  40.91 
 
 		 257 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  39.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  40.4 
 
 		 257 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  39.13 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  39.39 
 
 		 257 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  39.9 
 
 		 257 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 286 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 271 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  37.95 
 
 		 269 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  39.89 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  39.2 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  44.09 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  38.92 
 
 		 269 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 		 261 aa  130  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  38 
 
 		 271 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  37.68 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  39.5 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  38.25 
 
 		 260 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  38.25 
 
 		 260 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  38.25 
 
 		 260 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  36.68 
 
 		 282 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 321 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  35.35 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  41.46 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  39.42 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  41.46 
 
 		 278 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  36.87 
 
 		 255 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  42.39 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  42.93 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  39.89 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  41.85 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  36.27 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  35.26 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  39.34 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  40.56 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  37.37 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  35.38 
 
 		 343 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  33.16 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  39.76 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  33.94 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  37.43 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  37.71 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  31.92 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  35.75 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  35.2 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  36.42 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>