285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2427 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  100 
 
 
301 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  50.53 
 
 
288 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  50.7 
 
 
298 aa  292  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  48.77 
 
 
314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  48.76 
 
 
282 aa  262  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
298 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 
314 aa  231  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  42.39 
 
 
289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  34.16 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
261 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  39.83 
 
 
260 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  39.83 
 
 
260 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  36.63 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  39.42 
 
 
260 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  36.55 
 
 
257 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  37.5 
 
 
269 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
280 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  36.15 
 
 
257 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  36.13 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  36.07 
 
 
257 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  37.45 
 
 
278 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  36.13 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  36.13 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  34.85 
 
 
260 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  35.83 
 
 
269 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  36.13 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  36.13 
 
 
257 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  36.36 
 
 
260 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  35.66 
 
 
257 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  35.66 
 
 
257 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  35.66 
 
 
257 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  34.62 
 
 
260 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  35.25 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  35.71 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  35.71 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  36.1 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  34.14 
 
 
271 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  38.39 
 
 
278 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  35.04 
 
 
258 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  36.67 
 
 
272 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  38.98 
 
 
278 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  34.5 
 
 
276 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  43.95 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
331 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  41.74 
 
 
278 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
262 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
294 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
289 aa  135  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  33.83 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.46 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  34.7 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  44.12 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  36.29 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
306 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  37.78 
 
 
308 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  40.74 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  40.74 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  40.28 
 
 
276 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
261 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
327 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
303 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
321 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
301 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
319 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  40.57 
 
 
277 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  42.67 
 
 
307 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
325 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
317 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  39.63 
 
 
283 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
317 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  35.92 
 
 
315 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  38.97 
 
 
343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
358 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  37.5 
 
 
332 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  38.86 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  35.18 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  39.64 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
314 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
310 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
319 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  37.44 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  40.22 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>