More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  96.04 
 
 
278 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  67.52 
 
 
276 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  65.69 
 
 
276 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  61.15 
 
 
278 aa  341  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  61.51 
 
 
278 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  64.23 
 
 
276 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  63.14 
 
 
276 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  63.14 
 
 
276 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  64.21 
 
 
273 aa  331  9e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  62.87 
 
 
277 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 
261 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  50.46 
 
 
289 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  39.92 
 
 
272 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  45.97 
 
 
294 aa  191  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 
291 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  47.42 
 
 
262 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  42.45 
 
 
257 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  40 
 
 
260 aa  178  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  42.86 
 
 
273 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  43.91 
 
 
288 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  38.78 
 
 
271 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
281 aa  175  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  40.94 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  42.01 
 
 
265 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  45.28 
 
 
283 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  40.99 
 
 
269 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  42.79 
 
 
314 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 
278 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  43 
 
 
260 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  44.98 
 
 
271 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  50.25 
 
 
277 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  38.22 
 
 
257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  38.43 
 
 
260 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  38.43 
 
 
260 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  37.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  37.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  37.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  37.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  37.84 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  37.84 
 
 
257 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  43 
 
 
260 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  39.27 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  37.45 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  38.58 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  38.04 
 
 
260 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  42.65 
 
 
257 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
314 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  40.69 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  42.18 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  42.18 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  41.71 
 
 
257 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  38.49 
 
 
289 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  39.91 
 
 
258 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  40.28 
 
 
255 aa  158  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  36 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
298 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
303 aa  155  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
319 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
319 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  40.89 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.93 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
358 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
314 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  41.18 
 
 
327 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  40.39 
 
 
305 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 
321 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  45.99 
 
 
315 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  41.41 
 
 
303 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
300 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  40.53 
 
 
325 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  40 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  46.26 
 
 
307 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
315 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  47.48 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  40 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
310 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  39.66 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  41.95 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
310 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  40 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 
331 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
318 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>