More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1747 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  90.41 
 
 		 298 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  55.4 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  53.66 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  48.76 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  45.36 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  47.87 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  41.04 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  41.12 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  37.7 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  34.16 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  40.94 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  40.28 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  36.02 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  36.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  38.03 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  38.03 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  43.68 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  36.02 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  39.05 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  36.44 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  42.77 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  36.96 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  36.96 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  34.96 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  37.61 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  36.96 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  37.83 
 
 		 258 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  36.52 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  36.52 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  42.36 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.79 
 
 		 343 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  43.19 
 
 		 276 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  40 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  42.92 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  40.76 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  42.92 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  34.22 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  42.05 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  41.78 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  39.36 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  36.52 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  35.62 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  35.93 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  47.09 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  34.33 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  42.21 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  43.53 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  39.13 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  33.84 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  35.06 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  43.41 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 		 305 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  41.92 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 		 382 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  37.4 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  44.1 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 317 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 305 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  35.47 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  33.09 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  40.33 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  39.24 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>