280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2453 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  89.93 
 
 		 278 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  69.23 
 
 		 276 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  70.96 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  71.32 
 
 		 276 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  69.85 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  69.85 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  65.31 
 
 		 273 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  64.1 
 
 		 278 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  61.51 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  61.03 
 
 		 277 aa  311  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  49.54 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  46.76 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 286 aa  191  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  45.33 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  44.49 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  41.34 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  44.1 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  44.24 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  43.67 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  43.67 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  43.67 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  41.94 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  43.23 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  41.53 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  41.13 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  44 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  44 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  43.56 
 
 		 260 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  41.13 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  42.4 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  42.38 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  50.86 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  42.19 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  44.55 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  50 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  40.49 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  38.34 
 
 		 269 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  39.02 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  38.76 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  38.82 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  46.06 
 
 		 314 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  37.7 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  37.45 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  43.08 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 305 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 319 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  41.15 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  39.79 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  40.85 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 351 aa  132  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  45.34 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 358 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 317 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  45.34 
 
 		 319 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 310 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  32.87 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  40.1 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  39.41 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  38.94 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  39.16 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  44.08 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>