More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1137 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 286 aa  598  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  47.85 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  41.85 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  45.03 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  34.87 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  45.45 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  43.86 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  43.86 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  43.27 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  43.27 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  45.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  42.69 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  42.69 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  42.69 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  42.69 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  43.35 
 
 		 257 aa  143  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  42.69 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  42.69 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  42.05 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  44.24 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  42.11 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  43.11 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  40.33 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  43.03 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  43.51 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 358 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  42.76 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  35.21 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  38.25 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  39.39 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  39.77 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  41.92 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  38.69 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  32.56 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  40.91 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  41.82 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  41.82 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  42.17 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  35.12 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  41.21 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  36.41 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  41.48 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  40.61 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 319 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  42.94 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  30.84 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  36.42 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  37.41 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  32.11 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  35.52 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  37.16 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  33.88 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  32.43 
 
 		 319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  34.68 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  29.69 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  40.44 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  30.42 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  37.41 
 
 		 327 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>