More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00640 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 271 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  43.3 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  43.07 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  41.91 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  50 
 
 		 260 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  52.11 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  51.06 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  50.27 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  49.73 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  49.73 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  49.73 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  49.73 
 
 		 257 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  47.94 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  49.2 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  48.66 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  37.45 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  48.13 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  48.13 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  48.13 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  48.26 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  48.13 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  48.13 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  47.59 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  48.13 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  40.68 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  47.59 
 
 		 257 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  47.37 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  47.37 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  47.37 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  46.07 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  46.24 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  50 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  48.42 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  39.53 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  50.25 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  47.76 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  47.26 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  40.28 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  47.76 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  47.26 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  50.25 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  51.93 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  47.8 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  50.56 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 351 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 286 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  40.23 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  35.56 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  38.78 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  40.85 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  40.79 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  34.02 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  42.94 
 
 		 303 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 343 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  36.61 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  34.26 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 341 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  36.72 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  38.41 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  39.38 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  37.8 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  41.72 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  37.09 
 
 		 312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>