259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1047 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  84.92 
 
 		 305 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  63.12 
 
 		 319 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  62.46 
 
 		 319 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  60.53 
 
 		 319 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  60.2 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  53.16 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  52.48 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  52.33 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  52.69 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  53.36 
 
 		 342 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  46.13 
 
 		 310 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  48.4 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  48.23 
 
 		 315 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  45.12 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  47.85 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  56.72 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 319 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  48.96 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  56.72 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  42.62 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  50.21 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  59.55 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  41.97 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  58.99 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  52.97 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  47.64 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  46.98 
 
 		 303 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 339 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 382 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  53.3 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  47.55 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  50.94 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  40.7 
 
 		 474 aa  168  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  46.75 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  47.31 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  44.4 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  44.84 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  45.08 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  48.66 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 314 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.52 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  40.08 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  47.03 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  37.56 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  49.1 
 
 		 273 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  42.8 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  46.2 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  46.49 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  46.43 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  38.5 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 		 262 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  48.85 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  40 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  37.22 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  48.52 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  36.71 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  51.02 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  38.97 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  37.74 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  43.5 
 
 		 175 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  37.05 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  41.32 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  48.04 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  36.03 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  37.96 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  37.15 
 
 		 315 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  39.92 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  38.77 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  40.7 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  39.58 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  39.2 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  38.08 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  36.62 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  36.62 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  36.62 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>