272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0089 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 310 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  92.58 
 
 		 310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  85.02 
 
 		 310 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  75.49 
 
 		 342 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  75.58 
 
 		 312 aa  485  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  48.4 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  47.49 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  46.18 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  55.75 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  45.12 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  46 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 319 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  49.8 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  43.89 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  42.42 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  40.88 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  43.35 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  40.54 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  41.18 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  41.31 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  42.21 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  40.25 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  39.1 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 339 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  38.08 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  34.97 
 
 		 474 aa  170  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  35.76 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  37.73 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  48.08 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  37.59 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  35.01 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  34.65 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  44.63 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08204  NADH pyrophosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03360)  31.93 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0812746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  35.35 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  35.53 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  35.53 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  35.53 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  37.88 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  35.31 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  42.69 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  42.31 
 
 		 175 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  41.81 
 
 		 358 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  43.64 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  35.94 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  33.02 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  44.89 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  45.58 
 
 		 352 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  32.81 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  34.55 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  35.8 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  35.64 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  33.8 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  36.81 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  47.45 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  38.51 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  38.86 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  36.26 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  38.55 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  38.55 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>