More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4029 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  99.28 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  96 
 
 		 276 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  92.73 
 
 		 276 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  82.18 
 
 		 276 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  69.49 
 
 		 278 aa  400  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  69.85 
 
 		 278 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2071  NADH pyrophosphatase  67.53 
 
 		 273 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0635031  normal  0.0228012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27590  NADH pyrophosphatase  64.13 
 
 		 277 aa  340  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  63.14 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  65.07 
 
 		 278 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  47.34 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  47.51 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  44.29 
 
 		 272 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  54.12 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  45.97 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  42.33 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  42.08 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  43.13 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  44.44 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  43.13 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  43.48 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  40.17 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  43.13 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  44.02 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  42.18 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  42.65 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  41.33 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  42.65 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  41.71 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  42.18 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  47.76 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  41.23 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  41.23 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  41.23 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  41.23 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  41.23 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  41.23 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  40.76 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  39.24 
 
 		 260 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  39.24 
 
 		 260 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  42.03 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  42.92 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  43.6 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  38.82 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  39.81 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  42.65 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  38.43 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  42.72 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  40.87 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  42.78 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  39.15 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 319 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  39.15 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  38.92 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.86 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 		 351 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 		 339 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  34.72 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  38.55 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 		 327 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  43.75 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  42.66 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  39.6 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  36.7 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  38.5 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  40.21 
 
 		 303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 382 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>