184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1176 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 321 aa  630  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  51.8 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2899  NUDIX hydrolase  46.08 
 
 		 315 aa  232  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0947619  normal  0.0271253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  45.54 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  47.74 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  45.54 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 307 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3810  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  46.15 
 
 		 329 aa  208  9e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19160  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  49.4 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.188624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0784  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  43.89 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8362  NAD(+) diphosphatase  44.27 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  45.96 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  44.49 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3050  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  48.29 
 
 		 430 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3745  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.963277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  40.98 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 303 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  40.55 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  39.94 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  39.94 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  39.94 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  38.56 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  39.23 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  39.27 
 
 		 321 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  41.02 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  39.13 
 
 		 282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4126  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  41.13 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7348  putative mutT/Nudix hydrolase family protein  35.55 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4911  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3717  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  39.93 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1666  NUDIX hydrolase  43.3 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 382 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  37.58 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  45.32 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01890  NAD+ diphosphatase, putative  39.33 
 
 		 474 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1047  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2188  putative phosphohydrolase, MutT/NUDIX  37.67 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0173663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  34.8 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0019  NADH pyrophosphatase-like protein  34.09 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2295  NUDIX hydrolase  41.87 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11390  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  43.67 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4079  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2627  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.670801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  37.73 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3430  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4399  NAD(+) diphosphatase  42.55 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 262 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  39.47 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_004310  BR0036  MutT/nudix family protein  36.64 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  39.3 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0036  MutT/nudix family protein  40.57 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  36.51 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  34.35 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  35.98 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  37.04 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  35.98 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  35.98 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  35.98 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  37.57 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>