More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3444 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  82.35 
 
 		 187 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  82.89 
 
 		 187 aa  328  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  81.28 
 
 		 187 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  80.85 
 
 		 187 aa  314  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  80.85 
 
 		 187 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  80.85 
 
 		 187 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  80.32 
 
 		 187 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  48.55 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  46.75 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  48.88 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  45.4 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  43.35 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42.77 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  46.45 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 198 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 157 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  43.02 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  40.7 
 
 		 183 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  46.15 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  43.87 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  40 
 
 		 181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 186 aa  141  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  39.43 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  42.42 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  40.61 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  32.37 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  36.42 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.57 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  32.12 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.9 
 
 		 330 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>