More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0013 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 166 aa  323  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  41.51 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  39.24 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 		 187 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  39.24 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  38.31 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 198 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  37.89 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 		 181 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 195 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 183 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  32.91 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  37.89 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 185 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  37.89 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 182 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 196 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  38.89 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  36.02 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 187 aa  84.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  33.56 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  29.01 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 199 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  34.12 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>