More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2213 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  65.79 
 
 		 187 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  65.26 
 
 		 187 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  68.54 
 
 		 189 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  65.12 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  62.43 
 
 		 192 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  58.76 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  61.76 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  60.48 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 		 178 aa  210  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  58.19 
 
 		 178 aa  210  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  58.19 
 
 		 178 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 		 176 aa  208  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  58.18 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.73 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.73 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  56.73 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.73 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.73 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.73 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.73 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  56.98 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  59.51 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 193 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  53.01 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  51.81 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  51.14 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  35.86 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  34.72 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  36.51 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  30.3 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30208  predicted protein  31.34 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  38.6 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  29.19 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  34.91 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  36.92 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  36.59 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 286 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 318 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  28.03 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  29.73 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  31.69 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 323 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 319 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  30.71 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.76 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  37.29 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>