More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2533 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  68.39 
 
 
177 aa  273  9e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 
182 aa  246  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  58.05 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 
194 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  57.47 
 
 
181 aa  217  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  61.73 
 
 
183 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  59.28 
 
 
194 aa  215  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  55.75 
 
 
181 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  55.75 
 
 
181 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  56.74 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  60.49 
 
 
185 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  56.74 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  56.18 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
181 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  59.39 
 
 
184 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  58.54 
 
 
185 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  61.73 
 
 
183 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  58.79 
 
 
184 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 
198 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
181 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
181 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
181 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  54.02 
 
 
181 aa  204  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  52.87 
 
 
198 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  52.87 
 
 
181 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  54.6 
 
 
182 aa  201  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 
181 aa  198  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  53.45 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 
201 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  52.3 
 
 
183 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
187 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 
181 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
186 aa  190  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 
182 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 
182 aa  188  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 
196 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  59.39 
 
 
184 aa  187  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 
185 aa  185  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  55.33 
 
 
157 aa  184  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  47.7 
 
 
181 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 
187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  51.81 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  48.55 
 
 
187 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  49.08 
 
 
187 aa  176  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 
187 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  47.98 
 
 
187 aa  174  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  45.35 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 
182 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
187 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 
183 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  48.92 
 
 
212 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
190 aa  101  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  29.14 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  29.45 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.87 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.41 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.87 
 
 
209 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.41 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  30.41 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.41 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>