More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0480 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  35.37 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.88 
 
 		 144 aa  88.2  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  33.55 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  84.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  33.55 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  31.65 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  28.95 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  29.61 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.43 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 252 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  35.66 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  40.46 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  39.67 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  27.63 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>