More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0700 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  100 
 
 
132 aa  253  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  61.11 
 
 
144 aa  153  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  58.73 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  48 
 
 
171 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  50 
 
 
171 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
137 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
236 aa  118  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
149 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  48.48 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  50 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  52 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  48 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
150 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
151 aa  103  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  54.96 
 
 
140 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  46.83 
 
 
150 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
150 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
148 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
142 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
148 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  50 
 
 
154 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  55.86 
 
 
156 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
150 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 
140 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 
143 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  45.97 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
179 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  51.69 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
137 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  44.14 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
228 aa  90.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
252 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
229 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  47.58 
 
 
212 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
252 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  50 
 
 
226 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
176 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  44.67 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  50.56 
 
 
224 aa  80.9  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
260 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 
320 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  54.22 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
229 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 
249 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
153 aa  76.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
240 aa  76.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  39.84 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  43.7 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
198 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
223 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  40 
 
 
269 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  37.29 
 
 
181 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
662 aa  72  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
182 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
267 aa  72  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  43.81 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  43.81 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  43.81 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>