More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1935 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  100 
 
 
142 aa  288  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  66.41 
 
 
143 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  57.75 
 
 
148 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  63.16 
 
 
144 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  57.75 
 
 
148 aa  165  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  61.94 
 
 
143 aa  163  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  66.14 
 
 
154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  66.13 
 
 
150 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  61.72 
 
 
150 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  65.35 
 
 
150 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 
149 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 
150 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  59.35 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 
140 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  58.96 
 
 
153 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  59.54 
 
 
157 aa  140  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  56.92 
 
 
140 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  56.15 
 
 
140 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  57.81 
 
 
154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  52.59 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  57.36 
 
 
166 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
171 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
171 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
137 aa  124  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  50.4 
 
 
144 aa  123  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 
137 aa  122  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
171 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 
139 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  51.77 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  54.96 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 
176 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 
212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
236 aa  104  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
132 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
229 aa  100  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
240 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
229 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  48.15 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  40 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  40 
 
 
252 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
231 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
164 aa  83.6  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
228 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  39.53 
 
 
237 aa  77.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  53.93 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  39.06 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
237 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
303 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 
286 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  30 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
223 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
236 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
230 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.75 
 
 
362 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
231 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 
229 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
243 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
244 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
244 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
233 aa  62.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  32.23 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
662 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  32.23 
 
 
153 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
236 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>