More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0884 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  265  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  79.55 
 
 
139 aa  189  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  72.09 
 
 
136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 
141 aa  100  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
143 aa  90.9  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
162 aa  84.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  39.45 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  45.37 
 
 
473 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  38.13 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  38.13 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  42.11 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  40.37 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  40.37 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40.37 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  38.1 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  36 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  39.85 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  34.59 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  32 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  38.1 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.4 
 
 
139 aa  66.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.72 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.72 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.72 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.62 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  34.55 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  38.6 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.84 
 
 
346 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  35 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  36.52 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>