230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2728 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  65.24 
 
 		 234 aa  332  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  55.36 
 
 		 233 aa  275  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  55.3 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  53.48 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  52.19 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  47.09 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  38.65 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  37.26 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  34.8 
 
 		 254 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 258 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  33.01 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  30.45 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 221 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  32.02 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  30.45 
 
 		 269 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 662 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  27.63 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  29.95 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  32.98 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 		 232 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  30.62 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  29.53 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  27.64 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  30.93 
 
 		 275 aa  89  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  34.62 
 
 		 137 aa  85.5  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  29.81 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>