More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0022 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 267 aa  554  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  33.49 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  44.17 
 
 		 137 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  36.53 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  35.43 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 		 219 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  42.15 
 
 		 144 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 171 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 135 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  44.33 
 
 		 232 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 171 aa  85.9  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 225 aa  85.9  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 179 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  43.75 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  33.83 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  43.3 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 139 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.98 
 
 		 132 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  31.41 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 153 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 662 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  28.64 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.13 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.47 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  32.17 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  35.54 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>