224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0379 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  88.53 
 
 
219 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  75.69 
 
 
223 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  63.77 
 
 
226 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  52.4 
 
 
320 aa  246  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  59.9 
 
 
229 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  56.19 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  55.75 
 
 
248 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  55.91 
 
 
237 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  54.02 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
286 aa  216  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  56.33 
 
 
231 aa  215  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 
242 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  51.34 
 
 
249 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  52.27 
 
 
232 aa  209  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  52.65 
 
 
273 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  48.66 
 
 
662 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  53.7 
 
 
244 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  48.75 
 
 
263 aa  187  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 
269 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 
252 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
240 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 
248 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  42.51 
 
 
229 aa  147  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 
219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
251 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 
267 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  39.9 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
259 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 
231 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 
239 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  41.18 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  41 
 
 
243 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
229 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
244 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
228 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
255 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
225 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
233 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
242 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  35.98 
 
 
248 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  40.83 
 
 
228 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
251 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
202 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 
249 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
234 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
229 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
251 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  38.97 
 
 
252 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
251 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  39.27 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
303 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  38.5 
 
 
244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  40.09 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
284 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
236 aa  112  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  45.64 
 
 
186 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
234 aa  111  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
244 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
238 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
253 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
236 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  36.5 
 
 
219 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
252 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
230 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
233 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  33.81 
 
 
237 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  36.22 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  29.67 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 
248 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>