234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6281 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  68.33 
 
 		 244 aa  328  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  64.78 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  58.05 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  41.33 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.09 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 255 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  42.27 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  43.46 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 		 248 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  39.15 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  39.89 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  39.57 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.55 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 662 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 233 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  32.55 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  36.49 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  39.3 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000698  nudix-related transcriptional regulator NrtR  30.57 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0480026  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06576  hypothetical protein  30.57 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 251 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  38.16 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0042  hypothetical protein  29.2 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  32.78 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  40.29 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  33.49 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 186 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  37.22 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  36.23 
 
 		 137 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  41 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>