More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1179 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  100 
 
 
165 aa  336  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 
362 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 
349 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.8 
 
 
346 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.17 
 
 
345 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 
355 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.28 
 
 
345 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.06 
 
 
346 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.06 
 
 
346 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.06 
 
 
346 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50.35 
 
 
346 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  47.37 
 
 
344 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  47.37 
 
 
344 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.65 
 
 
346 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  45.4 
 
 
351 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.24 
 
 
338 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  44.59 
 
 
358 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  44.74 
 
 
348 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  44.59 
 
 
355 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1837  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.42 
 
 
367 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  41.61 
 
 
378 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4845  cytidyltransferase-like protein  39.35 
 
 
353 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  42.76 
 
 
356 aa  85.9  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 
252 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  42.14 
 
 
342 aa  84.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.75 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
273 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
229 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.24 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.25 
 
 
303 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 
286 aa  64.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  32.61 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
137 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
239 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
248 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
140 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  54.24 
 
 
136 aa  61.6  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
246 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
134 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
237 aa  61.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
267 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
662 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
132 aa  60.5  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
320 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  33.9 
 
 
224 aa  58.9  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
137 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
229 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  58.2  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
223 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  28.48 
 
 
237 aa  57.4  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
219 aa  57.4  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  27.03 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  36 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  40 
 
 
242 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
249 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
260 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
248 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  45 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
269 aa  54.7  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  33.79 
 
 
232 aa  54.3  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
225 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
147 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  35 
 
 
126 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
141 aa  53.9  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>