256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2328 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 237 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  95.78 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  42.29 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  41.41 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.91 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  37.61 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.25 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  37.17 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 303 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  37.92 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  34.47 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 251 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 273 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 662 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  40.21 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  35.1 
 
 		 219 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 251 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  35.24 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  35.55 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 320 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  30.74 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 		 255 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 202 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  30.63 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06576  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0042  hypothetical protein  27.59 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  34.33 
 
 		 137 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  27.67 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  28.63 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000698  nudix-related transcriptional regulator NrtR  27.23 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0480026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 186 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  29.54 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  28.22 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>