129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06576 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06576  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000698  nudix-related transcriptional regulator NrtR  95.02 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0480026  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0042  hypothetical protein  60.17 
 
 		 238 aa  322  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  31.44 
 
 		 252 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  32.08 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  29.65 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  29.65 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  27.8 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  27.63 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 		 267 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  27.65 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  27.9 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 		 662 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  26.86 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  27.23 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  27.51 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  28.51 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  28.63 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  26.92 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  25.11 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  27.16 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  27.63 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  27.39 
 
 		 236 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  25.82 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  25.82 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  25.09 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  26.11 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  24.56 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  24.32 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  26.02 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  24.89 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  26.87 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  26.34 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  26.25 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  24.89 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  26.19 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  27.19 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  24.9 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  28.28 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  25.34 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  24.12 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  23.99 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  27.37 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  23.56 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  23.12 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  28.44 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  26.37 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  26.49 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  30.52 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  24.53 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  24.2 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>