182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3715 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  100 
 
 
222 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
242 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  42.92 
 
 
252 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
219 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  40.55 
 
 
244 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  40.25 
 
 
267 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
252 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
252 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  41.28 
 
 
252 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
229 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
229 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  37.16 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  40 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
239 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
243 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
231 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  36.84 
 
 
219 aa  121  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  40.09 
 
 
237 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
229 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 
255 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 
225 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  115  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.11 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
231 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
234 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
233 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
286 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  37.56 
 
 
242 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.28 
 
 
232 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  36.98 
 
 
228 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 
234 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
244 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
238 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  35 
 
 
662 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  39.59 
 
 
275 aa  101  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
224 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
251 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
246 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 
236 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
248 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  39.11 
 
 
216 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
251 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  35 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  30 
 
 
236 aa  95.5  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
251 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  33.91 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
254 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 
303 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  29.96 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  34.76 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
249 aa  91.7  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  38.3 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  31.89 
 
 
320 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 
263 aa  88.2  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
217 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
217 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
254 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
271 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  30.57 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  31.66 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>