164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0588 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  56.5 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  47.44 
 
 		 244 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  42.63 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  43.91 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.84 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  39.48 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 229 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 		 234 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.56 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 251 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 239 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  27.85 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  30.04 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  25.6 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  29.19 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 		 284 aa  85.9  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  29.19 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  27.9 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  28.87 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.65 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  26.84 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  28.88 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  24.88 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  26.6 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  29.74 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  23.42 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  23.45 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 223 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  26.13 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  26 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  30.13 
 
 		 137 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  25.32 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  24.56 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  24.54 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  26.6 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  24.6 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  25.96 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  29.9 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  24.56 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>