174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3729 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  59.11 
 
 		 245 aa  279  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 238 aa  261  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  50.23 
 
 		 245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  49.55 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  49.08 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  45.18 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 251 aa  154  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  36.82 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  41.12 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  36.95 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  36.95 
 
 		 252 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 233 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  30.74 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  37.77 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 303 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 		 251 aa  118  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  36.16 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  35.68 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  28.63 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  32.51 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  31.72 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  30.32 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  30.73 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  34.74 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 662 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  30.85 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 320 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  31.64 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  29.35 
 
 		 219 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  26.23 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>